元町駅の特徴として、まず乗り入れ路線が挙げられます。JR東海道本線(JR神戸線)が主要路線ですが、これに加えて神戸市営地下鉄西神・山手線も乗り入れており、利用者の利便性が高くなっています。地下鉄との乗り換えは同一改札内で行えるため、スムーズな乗り換えが可能です。
また、元町駅は神戸の商業の中心地に位置しており、駅周辺には元町商店街や南京町(神戸中華街)などの観光スポットが多数あります。このため、観光客や買い物客の利用も多く、神戸の街の賑わいを支える重要な交通拠点となっています。
駅構造としては、JR線は高架式で2面4線を有しており、快速や新快速も停車する利便性の高い駅となっています。地下鉄との接続も考慮された設計で、バリアフリー化も進んでおり、エレベーターやエスカレーターが整備されています。
元町駅は、神戸の歴史と現代が融合した街の中心に位置し、交通の要所として、また観光や商業の中心地として、神戸の都市機能を支える重要な役割を果たしています。